40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0804 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  66.97 
 
 		 218 aa  311  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  64.22 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  62.38 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  43.07 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  33.5 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  33.5 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  29.84 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  32.7 
 
 		 252 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  30.93 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  29.89 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  26.97 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  27.31 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  28.89 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  29.38 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  25.82 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  28.64 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  27.12 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  27.23 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  29.35 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  27.23 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  30.52 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  29.61 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  26.55 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  26.97 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  25.14 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  24.29 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26530  hypothetical protein  38.96 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  30.43 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  26.58 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  30.56 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  28.29 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  28.26 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  24.21 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  24.74 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>