49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0296 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  29.31 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  32.62 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  28.5 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  29.18 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  28.02 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  28.23 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  31.72 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  28.85 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  27.59 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  26.75 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  27.75 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  29.19 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  27.66 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  26.79 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  26.21 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  27.35 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  26.23 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  26.92 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  25.85 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  25.42 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  25.44 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  25.44 
 
 		 323 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  25.44 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  28.34 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  25.25 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  25.24 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  27.64 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  25.25 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  25.25 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  28.77 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  26.64 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  27.36 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  27.4 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  27.55 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  27.92 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  28.49 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  27.98 
 
 		 218 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  24.64 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3952  hypothetical protein  23.38 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  26.63 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>