39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0297 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  25.44 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  31.46 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  27.65 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  31.95 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  30.59 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  28.92 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  29.76 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  26.54 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  29.17 
 
 
246 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  24.64 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  27.9 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  26.51 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  28.05 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  27.78 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  26.34 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  29.52 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  28.75 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  23.65 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  27.5 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  26.09 
 
 
223 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  27.16 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  24.02 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  28.05 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  22.52 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  29.87 
 
 
259 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  26.87 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  26.38 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  23.12 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  23.08 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  22.08 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  24.38 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  22.98 
 
 
251 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>