47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1928 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  98.4 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  70.54 
 
 		 259 aa  362  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  66 
 
 		 250 aa  351  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  65.74 
 
 		 260 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  68.15 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  53.88 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  53.54 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  59.22 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  52.74 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  55.51 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  47.79 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  39.75 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  41.53 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  39.74 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  38.96 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  42.93 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  34.51 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  31.47 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  31.47 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  32.6 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  26.89 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  26.72 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  31.48 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  28.12 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  26.92 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  24.29 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  30.43 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  25.81 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  27.23 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  27.63 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  27.5 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  27.5 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  27.16 
 
 		 323 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0652  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  22.9 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  22.9 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>