49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4860 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  67.57 
 
 
223 aa  326  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  33.82 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  35.98 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  35.26 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  36.04 
 
 
251 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  32.5 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  35.6 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  35.83 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  33.85 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  33.5 
 
 
219 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  32.6 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  32.16 
 
 
250 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  33.82 
 
 
260 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  32.43 
 
 
262 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  31.36 
 
 
241 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  33.68 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  30.34 
 
 
245 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  33.01 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  29.15 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  32.38 
 
 
240 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  32.81 
 
 
249 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  33.54 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  33.5 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  32.06 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  31.82 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  29.56 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  29.56 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  29.74 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  31.82 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  30.73 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  30.85 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  28.57 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  27.64 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  28 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26530  hypothetical protein  30.33 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  24.87 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  24.87 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  24.23 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3952  hypothetical protein  23.98 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  22.08 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  22.08 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  22.08 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  22.08 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  22.08 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  22.08 
 
 
323 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>