14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3952 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3952  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  604  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  23.58 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  21.92 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  25.13 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  22.91 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  23.38 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  26.04 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  24.12 
 
 
236 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  32.35 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  24.12 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  24.12 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  24.07 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  23.98 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>