50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1488 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  55.65 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  55.74 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  56.96 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  52.84 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  53.14 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  45.23 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  43.16 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  43.23 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  42.5 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  42.61 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  42.48 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  40.81 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  40.08 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  43.43 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  39.91 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  40.32 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  42.93 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  35.86 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  37.79 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  37.79 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  37.33 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  43.65 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  34.96 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  37.55 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  31.54 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  31.28 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  27.05 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  33.5 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  28.21 
 
 		 208 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  28.04 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  28.85 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  27.45 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  27 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  27 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  26.44 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  30.14 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  26.44 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  26.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  26.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  26.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  26.44 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  27.1 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  27.1 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3952  hypothetical protein  25.73 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  24.36 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>