46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0643 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  68.55 
 
 
250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  68.15 
 
 
250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  69.26 
 
 
259 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  65.2 
 
 
250 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  63.14 
 
 
260 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  55.87 
 
 
251 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  55.7 
 
 
232 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  55.04 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  60.4 
 
 
249 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  59.61 
 
 
250 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  49.03 
 
 
262 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  56.54 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  41.94 
 
 
241 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  41.85 
 
 
245 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  38.22 
 
 
252 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  44.17 
 
 
240 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  41.1 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  35.81 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  43.65 
 
 
241 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  36 
 
 
272 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  36.8 
 
 
236 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  39.49 
 
 
236 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  39.49 
 
 
236 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  30.42 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  30.7 
 
 
222 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  31.96 
 
 
223 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  28.39 
 
 
252 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  28.27 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  24.44 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  28.19 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  27.57 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  27.62 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  25.4 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  24.47 
 
 
218 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  27.17 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  25.38 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  22.27 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  22.27 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  29.1 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  25.48 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  25.48 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  25.48 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  25.48 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  25.48 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  25.48 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>