43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3616 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  83.6 
 
 		 249 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  58.44 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  56.45 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  58.41 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  59.43 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  52.74 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  52.74 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  56.1 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  56.44 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  59.3 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  59.11 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  43.46 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  41.18 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  41.77 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  37.7 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  42.61 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  42.5 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  39.9 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  42.18 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  34.2 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  30.73 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  33.68 
 
 		 222 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  33.03 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  28.84 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  30.59 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  27.92 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  29.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  25.37 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  24.38 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  24.38 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  24.38 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  24.38 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  24.38 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  24.38 
 
 		 323 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>