48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1002 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  100 
 
 
262 aa  534  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  56.75 
 
 
253 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  61.27 
 
 
249 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  56.2 
 
 
251 aa  258  9e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  51.78 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  58.41 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  51.08 
 
 
232 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  47.79 
 
 
250 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  47.79 
 
 
250 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  56.2 
 
 
263 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  49.8 
 
 
259 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  47.64 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  47.86 
 
 
270 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  43 
 
 
252 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  35.56 
 
 
272 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  39.91 
 
 
241 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  37.97 
 
 
245 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  33.74 
 
 
258 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  34.41 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  40.5 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  38.4 
 
 
240 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  40.17 
 
 
246 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  35.22 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  39.39 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  39.39 
 
 
236 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  39.39 
 
 
236 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  33.62 
 
 
260 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  28.51 
 
 
214 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  25.85 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  30.1 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  26.84 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  27.14 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  29.35 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  23.85 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  25.34 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  23.2 
 
 
245 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  24.48 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  24.48 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  22.83 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  25.37 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  23.12 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  23.12 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  23.12 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  23.12 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  23.12 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  23.12 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>