18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26530  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  38.96 
 
 
219 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  43.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  37.66 
 
 
214 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  26.78 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  30.33 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  35.06 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  30.68 
 
 
252 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  30.65 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  25.56 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  31.34 
 
 
243 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  31.07 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  27.47 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  23.74 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  27.75 
 
 
236 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>