253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1504 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1504  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1505  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  77.59 
 
 
181 aa  270  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000155042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05820  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.11 
 
 
186 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.300525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2818  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  42.5 
 
 
229 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.647685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1196  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  42.29 
 
 
217 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251178  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4662  pyridoxamine-phosphate oxidase  38.73 
 
 
222 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.67 
 
 
223 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0703694  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0497  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  41.58 
 
 
223 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  36.51 
 
 
212 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.78 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28380  pyridoxamine-phosphate oxidase  42.79 
 
 
232 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.07 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.16 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.57 
 
 
213 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.91 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.84 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.67 
 
 
212 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.81 
 
 
214 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.08 
 
 
212 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.83 
 
 
214 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.81 
 
 
214 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.81 
 
 
214 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.43 
 
 
211 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.14 
 
 
213 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 
214 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 
214 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 
217 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.51 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.57 
 
 
215 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.66 
 
 
214 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.16 
 
 
215 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.72 
 
 
212 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.81 
 
 
216 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.05 
 
 
213 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.8 
 
 
216 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.02 
 
 
202 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.9 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.92 
 
 
239 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.11 
 
 
212 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.22 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.48 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.57 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.27 
 
 
258 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.41 
 
 
225 aa  98.6  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.52 
 
 
265 aa  97.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36 
 
 
229 aa  97.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.39 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.52 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.89 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.43 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.16 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.29 
 
 
214 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4458  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.86 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.86 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.603772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.04 
 
 
215 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.97 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.07 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.52 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.97 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.24 
 
 
224 aa  94.7  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.39 
 
 
217 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.15 
 
 
214 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.94 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  30.69 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  30.69 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.83 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.2 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.63 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4840  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.29 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 
211 aa  92.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.25 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.14 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_002978  WD1159  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.24 
 
 
216 aa  92  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.15 
 
 
217 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.81 
 
 
215 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.97 
 
 
215 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.08 
 
 
215 aa  91.3  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.05 
 
 
231 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.97 
 
 
215 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.42 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.94 
 
 
218 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.42 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.22 
 
 
215 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.67 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.82 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.67 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2993  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.57 
 
 
213 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.047465  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.64 
 
 
221 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.87 
 
 
213 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.55 
 
 
233 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 
222 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>