255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2922 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  76.92 
 
 
215 aa  333  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  79.9 
 
 
224 aa  331  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  76.44 
 
 
217 aa  325  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  75.48 
 
 
217 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  73.56 
 
 
226 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  75.12 
 
 
225 aa  315  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  72.73 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  73.08 
 
 
212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  69.09 
 
 
258 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  72.25 
 
 
215 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  70.81 
 
 
215 aa  304  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.5 
 
 
213 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.15 
 
 
214 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.79 
 
 
214 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.15 
 
 
214 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.97 
 
 
214 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.15 
 
 
214 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
212 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.28 
 
 
265 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
214 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.44 
 
 
214 aa  254  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
212 aa  254  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.44 
 
 
214 aa  254  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.62 
 
 
213 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.48 
 
 
211 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.08 
 
 
212 aa  242  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
213 aa  240  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
212 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.02 
 
 
212 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.02 
 
 
212 aa  235  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
211 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.6 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.4 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.34 
 
 
215 aa  230  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
210 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.98 
 
 
215 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.89 
 
 
211 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
215 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.87 
 
 
215 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.87 
 
 
215 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.98 
 
 
211 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  225  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.87 
 
 
215 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.5 
 
 
213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.81 
 
 
215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.99 
 
 
215 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
215 aa  218  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.59 
 
 
213 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
214 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.38 
 
 
217 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.04 
 
 
202 aa  207  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.17 
 
 
212 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  52.88 
 
 
217 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  48.1 
 
 
212 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.72 
 
 
211 aa  203  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.58 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.66 
 
 
261 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.7 
 
 
217 aa  197  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.8 
 
 
225 aa  194  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
215 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.6 
 
 
212 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.86 
 
 
213 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.76 
 
 
221 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.13 
 
 
213 aa  190  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.47 
 
 
218 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  43.87 
 
 
215 aa  187  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  43.4 
 
 
215 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
212 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.86 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.41 
 
 
233 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.23 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.24 
 
 
212 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.24 
 
 
212 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.84 
 
 
239 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.8 
 
 
214 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.45 
 
 
216 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.34 
 
 
217 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1714  pyridoxamine-phosphate oxidase  44.08 
 
 
214 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.74 
 
 
200 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.4 
 
 
225 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.89 
 
 
222 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7230  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.25 
 
 
254 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.714905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.36 
 
 
231 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.02 
 
 
213 aa  178  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>