262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0332 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  68.25 
 
 
211 aa  294  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  68.25 
 
 
211 aa  292  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.73 
 
 
214 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.73 
 
 
214 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.71 
 
 
229 aa  274  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.73 
 
 
214 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.32 
 
 
214 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.02 
 
 
214 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
215 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.11 
 
 
213 aa  267  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.85 
 
 
214 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.85 
 
 
215 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.38 
 
 
214 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.74 
 
 
213 aa  260  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.74 
 
 
213 aa  259  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.97 
 
 
265 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.09 
 
 
224 aa  257  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.61 
 
 
212 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.02 
 
 
215 aa  255  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.14 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.77 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.72 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.19 
 
 
212 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
214 aa  252  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.57 
 
 
212 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.55 
 
 
215 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.6 
 
 
215 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.48 
 
 
211 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.6 
 
 
215 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.91 
 
 
239 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.05 
 
 
212 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.98 
 
 
213 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.66 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.66 
 
 
215 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.05 
 
 
215 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.57 
 
 
215 aa  242  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.6 
 
 
215 aa  242  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.19 
 
 
215 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.29 
 
 
213 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
226 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.62 
 
 
217 aa  238  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.16 
 
 
258 aa  238  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.19 
 
 
215 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.35 
 
 
215 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.12 
 
 
202 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.76 
 
 
217 aa  235  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.67 
 
 
217 aa  235  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.13 
 
 
210 aa  234  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.52 
 
 
225 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.08 
 
 
211 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.67 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.73 
 
 
214 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.25 
 
 
211 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.28 
 
 
214 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  55.71 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.61 
 
 
212 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.72 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
212 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.07 
 
 
214 aa  216  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
212 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
213 aa  215  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.69 
 
 
217 aa  214  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.55 
 
 
261 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.67 
 
 
210 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  47.14 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  47.64 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  46.67 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.09 
 
 
222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.6 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.02 
 
 
224 aa  211  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
213 aa  210  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.23 
 
 
201 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.34 
 
 
211 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.39 
 
 
211 aa  208  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.56 
 
 
233 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
215 aa  207  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.49 
 
 
221 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.05 
 
 
212 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  47.39 
 
 
213 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.39 
 
 
211 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.89 
 
 
213 aa  205  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.5 
 
 
213 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.1 
 
 
212 aa  204  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.82 
 
 
232 aa  204  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.4 
 
 
218 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0654  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.78 
 
 
216 aa  203  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.273077  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.24 
 
 
225 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.97 
 
 
207 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.932005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>