253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0424 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
261 aa  520  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  90.91 
 
 
221 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.77 
 
 
217 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.82 
 
 
211 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.86 
 
 
222 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.59 
 
 
225 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.13 
 
 
224 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  58.77 
 
 
217 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0501  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.88 
 
 
219 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.35 
 
 
213 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7230  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
254 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.714905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.14 
 
 
211 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
212 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.93 
 
 
214 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.93 
 
 
214 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
214 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.46 
 
 
214 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.93 
 
 
239 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.99 
 
 
214 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.99 
 
 
214 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.75 
 
 
231 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.46 
 
 
214 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.93 
 
 
202 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.19 
 
 
212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.08 
 
 
212 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.58 
 
 
213 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.71 
 
 
217 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.5 
 
 
214 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
214 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.55 
 
 
211 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.3 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.34 
 
 
214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.09 
 
 
213 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.25 
 
 
212 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
212 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0079  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56 
 
 
278 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
212 aa  211  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.77 
 
 
212 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.95 
 
 
217 aa  208  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
217 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
212 aa  206  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  45.5 
 
 
212 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.17 
 
 
215 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.34 
 
 
214 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.61 
 
 
224 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.98 
 
 
222 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.25 
 
 
225 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
229 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
211 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.64 
 
 
215 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.57 
 
 
211 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
215 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.56 
 
 
239 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.77 
 
 
226 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.91 
 
 
213 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
215 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.18 
 
 
217 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.64 
 
 
215 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
212 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
212 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
215 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.19 
 
 
213 aa  201  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.85 
 
 
215 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.85 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.11 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.66 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4840  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.12 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4458  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.22 
 
 
220 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.39 
 
 
215 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0734  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.82 
 
 
213 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.22 
 
 
220 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.603772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3147  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.48 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0321619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.82 
 
 
215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0849  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.75 
 
 
206 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.29 
 
 
215 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1727  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.15 
 
 
218 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.84 
 
 
217 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.12 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.33 
 
 
233 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
218 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
218 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
218 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
218 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0190742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.574434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1618  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  0.71127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.24 
 
 
212 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  45.02 
 
 
218 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>