253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4545 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4458  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.603772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4840  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  99.52 
 
 
209 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1727  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  77.42 
 
 
218 aa  349  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12626  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  70.45 
 
 
224 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00682277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5024  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  75.34 
 
 
222 aa  324  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0849  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.14 
 
 
206 aa  248  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.41 
 
 
222 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.8 
 
 
231 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0501  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.78 
 
 
219 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.22 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.55 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.11 
 
 
224 aa  194  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.25 
 
 
225 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.23 
 
 
211 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.18 
 
 
211 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.11 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  0.0000390202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7230  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.67 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.714905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  47.62 
 
 
212 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.57 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.93 
 
 
212 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.93 
 
 
212 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.96 
 
 
215 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.34 
 
 
239 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.93 
 
 
212 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.96 
 
 
215 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
213 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.5 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.12 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.37 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.5 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.5 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.5 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.27 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46 
 
 
211 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
213 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.18 
 
 
215 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.3 
 
 
215 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
211 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.97 
 
 
202 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.08 
 
 
222 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.58 
 
 
215 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.89 
 
 
215 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.72 
 
 
217 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.8 
 
 
213 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.89 
 
 
215 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.83 
 
 
212 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
213 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.75 
 
 
231 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.47 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.08 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.32 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.82 
 
 
208 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.82 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.77 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.62 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  46.11 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.8 
 
 
213 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.33 
 
 
212 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.5 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1259  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.35 
 
 
215 aa  160  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000619005  normal  0.0127677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.58 
 
 
212 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
239 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.58 
 
 
212 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.7 
 
 
214 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  40.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.49 
 
 
217 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.49 
 
 
217 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.22 
 
 
240 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.19 
 
 
212 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.55 
 
 
212 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.49 
 
 
217 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.65 
 
 
218 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.07 
 
 
233 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.09 
 
 
218 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000320957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.12 
 
 
221 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.65 
 
 
218 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.06 
 
 
209 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.01 
 
 
232 aa  158  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30330  pyridoxamine-phosphate oxidase  46.97 
 
 
227 aa  158  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1810  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.94 
 
 
218 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00431301  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.24 
 
 
213 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.13 
 
 
215 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>