254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1263 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1727  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.84 
 
 
218 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4458  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.8 
 
 
220 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.8 
 
 
220 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.603772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4840  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.8 
 
 
209 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0849  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.46 
 
 
206 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12626  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.39 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00682277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5024  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.28 
 
 
222 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0501  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.35 
 
 
219 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.09 
 
 
222 aa  207  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.82 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.53 
 
 
213 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.72 
 
 
211 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.26 
 
 
211 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.47 
 
 
213 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.6 
 
 
211 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.75 
 
 
213 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.5 
 
 
261 aa  187  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.49 
 
 
221 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.74 
 
 
214 aa  185  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.76 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.85 
 
 
214 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.79 
 
 
217 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.8 
 
 
211 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.15 
 
 
214 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.89 
 
 
214 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.21 
 
 
213 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.89 
 
 
214 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.85 
 
 
214 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.83 
 
 
239 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.98 
 
 
212 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.18 
 
 
229 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
212 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.6 
 
 
214 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  0.0000390202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
265 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
215 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.85 
 
 
212 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.72 
 
 
212 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.41 
 
 
214 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.41 
 
 
214 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.72 
 
 
212 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
214 aa  175  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
212 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.81 
 
 
217 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.15 
 
 
212 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.29 
 
 
215 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
214 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.41 
 
 
214 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
215 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
217 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
215 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.8 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  44.27 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.43 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.74 
 
 
213 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.74 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.47 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.94 
 
 
211 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
215 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.6 
 
 
215 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7230  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.72 
 
 
254 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.714905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.38 
 
 
239 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.13 
 
 
212 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.02 
 
 
224 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
217 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.6 
 
 
231 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.05 
 
 
215 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.32 
 
 
224 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.76 
 
 
217 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
226 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.43 
 
 
211 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.93 
 
 
211 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  46.28 
 
 
217 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.04 
 
 
213 aa  165  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.63 
 
 
233 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.68 
 
 
212 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.6 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.6 
 
 
208 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2993  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.94 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.047465  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.44 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.14 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0021  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.71 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.67 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  44.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.15 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.03 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>