210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0472 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0472  hemolysin A  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.517404  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  44.19 
 
 
266 aa  221  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  45.04 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  45.04 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  46.25 
 
 
271 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  45.2 
 
 
269 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  45.64 
 
 
278 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  45.83 
 
 
252 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  45.99 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  44.54 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  46.72 
 
 
282 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  42.92 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  42.92 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  42.26 
 
 
276 aa  195  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  45.61 
 
 
277 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  42.5 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.14 
 
 
273 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  42.98 
 
 
268 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  42.98 
 
 
257 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08030  hemolysin A  47.74 
 
 
247 aa  192  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193218  hitchhiker  0.000000581038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.62 
 
 
367 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04750  hemolysin A  46.67 
 
 
243 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000612241  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  44.67 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  44.67 
 
 
264 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  42.02 
 
 
248 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  43.21 
 
 
272 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  43.43 
 
 
272 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  41.25 
 
 
250 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  41.31 
 
 
276 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40.76 
 
 
268 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  40.51 
 
 
264 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2697  hemolysin A  44.96 
 
 
248 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  41.84 
 
 
257 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  40.49 
 
 
267 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  43.88 
 
 
267 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  43.88 
 
 
267 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  44.18 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  44.09 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  42.26 
 
 
264 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  43.75 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  41.67 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  43.23 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  40.23 
 
 
279 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  42.74 
 
 
279 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  43.33 
 
 
279 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  41.53 
 
 
271 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  46.36 
 
 
227 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  42.74 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  42.98 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  42.74 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  42.98 
 
 
266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  43.7 
 
 
249 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  44.18 
 
 
271 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  43.09 
 
 
270 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  40.24 
 
 
264 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  41.84 
 
 
270 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  41.74 
 
 
248 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  44.03 
 
 
267 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  41.63 
 
 
251 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  43.62 
 
 
267 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  39.48 
 
 
268 aa  176  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  40.98 
 
 
242 aa  175  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  40.74 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  41.3 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  42.15 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  39.1 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  45.14 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  39.42 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  39.33 
 
 
270 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  40 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  41.04 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  38.6 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  40.31 
 
 
284 aa  171  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  39.26 
 
 
272 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  42.63 
 
 
269 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  41.7 
 
 
252 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  41.03 
 
 
240 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  39.53 
 
 
275 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  40.66 
 
 
288 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  39.66 
 
 
266 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  41.95 
 
 
250 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  41.6 
 
 
266 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  44.12 
 
 
260 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  41.6 
 
 
277 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  41.67 
 
 
247 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  39.83 
 
 
287 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  43.27 
 
 
268 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  41.91 
 
 
252 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  40.33 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  41.1 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  40.17 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  41.43 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  39.58 
 
 
272 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  40.91 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  40.91 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>