123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0510 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
175 aa  343  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.49 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  27.63 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.49 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  28.23 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  23.26 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  27.7 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  31.76 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  25.62 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.65 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
189 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  26.49 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.3 
 
 
199 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  28.36 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.79 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.81 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  26.11 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  24.81 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.25 
 
 
270 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  22.82 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.22 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 
203 aa  44.7  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  26.7 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  26.79 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.71 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  26.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  28.49 
 
 
195 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  23.35 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  29.9 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  23.95 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>