More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4479 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
383 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138195  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7076  zinc-binding dehydrogenase  38.78 
 
 
353 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
343 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 
336 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
327 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.51 
 
 
336 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.37 
 
 
340 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  26.4 
 
 
343 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
347 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.65 
 
 
343 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.64 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.64 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  25.25 
 
 
340 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
346 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  24.71 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  23.48 
 
 
336 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  24.78 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.54 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.69 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
318 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
349 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
340 aa  93.2  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  27.96 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  23.84 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.84 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  23.55 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
323 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  23.84 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  23.84 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  23.74 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  25 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.94 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  25 
 
 
339 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.49 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  25 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.74 
 
 
359 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.89 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
344 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.59 
 
 
343 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  24.69 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.1 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.65 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
345 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3757  L-threonine 3-dehydrogenase  34.1 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.119635  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  27.37 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  27.79 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  24.65 
 
 
375 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  29.33 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.63 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.7 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.33 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.23 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.84 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.33 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.89 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.78 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  28.89 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  28.89 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.89 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.65 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.81 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.89 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.33 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.44 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.45 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.44 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.08 
 
 
333 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.17 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  25.4 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  26.54 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.46 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  27.2 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  26.9 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.44 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3225  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.87 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3287  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.07 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>