37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3611 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3611  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 836 aa  1595    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.54 
 
 		 850 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.86 
 
 		 851 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.05 
 
 		 845 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25 
 
 		 843 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 849 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 849 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  30.81 
 
 		 827 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 		 930 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.04 
 
 		 849 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 806 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  30.69 
 
 		 839 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 855 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 852 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.36 
 
 		 837 aa  53.5  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 855 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.49 
 
 		 842 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 846 aa  52  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.48 
 
 		 855 aa  51.6  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.44 
 
 		 858 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 855 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 855 aa  48.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.78 
 
 		 841 aa  47.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 822 aa  47.8  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 834 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  26.29 
 
 		 843 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 857 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  22.77 
 
 		 379 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.91 
 
 		 896 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.11 
 
 		 852 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.64 
 
 		 859 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  23.75 
 
 		 870 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 379 aa  44.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.15 
 
 		 857 aa  44.3  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>