More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3063 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3063  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
304 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.06 
 
 
302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.775129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1312  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.82 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.12 
 
 
370 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.61 
 
 
301 aa  123  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  36.3 
 
 
353 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.7 
 
 
307 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.09 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35 
 
 
318 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
313 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.12 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.14 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  32.99 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.49 
 
 
350 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.43 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.91 
 
 
352 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.05 
 
 
311 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.85 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.8 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.17 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.52 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.21 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  32.89 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.55 
 
 
326 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  35.59 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.41 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
329 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  33.49 
 
 
337 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.55 
 
 
325 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.28 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.71 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.48 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.8 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.93 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4661  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 
330 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.879161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
344 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.46 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.04 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.42 
 
 
324 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 
344 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  34.06 
 
 
348 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  36.73 
 
 
341 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.82 
 
 
313 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.66 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.51 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.86 
 
 
349 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.07 
 
 
344 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.08 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
344 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.23 
 
 
309 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 
312 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.51 
 
 
321 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.05 
 
 
330 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.09 
 
 
317 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.74 
 
 
317 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.97 
 
 
312 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4715  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
296 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
344 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.31 
 
 
339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 
344 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  37.7 
 
 
305 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  36.51 
 
 
320 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.26 
 
 
347 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  35.07 
 
 
337 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.89 
 
 
321 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.02 
 
 
342 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.29 
 
 
339 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
339 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.63 
 
 
308 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.39 
 
 
311 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.61 
 
 
311 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.05 
 
 
324 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.99 
 
 
330 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36.82 
 
 
327 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.76 
 
 
339 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.67 
 
 
338 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.54 
 
 
320 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.61 
 
 
308 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.59 
 
 
313 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.39 
 
 
320 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.24 
 
 
311 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  32.52 
 
 
376 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  34.12 
 
 
339 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.77 
 
 
316 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  34.12 
 
 
444 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.43 
 
 
338 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.43 
 
 
338 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 
340 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
338 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  36.05 
 
 
321 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.6 
 
 
319 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 
319 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>