More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2819 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2819  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
451 aa  854    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
374 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
345 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 
381 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 
381 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  31.11 
 
 
381 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  31.11 
 
 
381 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  31.11 
 
 
381 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 
381 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
818 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
398 aa  86.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  46.1 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 
360 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  40.22 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  34.43 
 
 
820 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  35.02 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  43.8 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.79 
 
 
371 aa  84  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  32.95 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  46.72 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  50.86 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  30.34 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  39.47 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  41.5 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
828 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  43.86 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.43 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 
800 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  31.74 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  34.85 
 
 
383 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
399 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  39.6 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 
383 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  37.43 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  31.58 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  36.84 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  41.36 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
368 aa  77  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  40.34 
 
 
381 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  38.69 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.19 
 
 
769 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>