174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0142 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  64.02 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  63.07 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.02 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.11 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.5 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  47.67 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.86 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.2 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.2 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.2 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  43.98 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.62 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.48 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.86 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.43 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.95 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  47.51 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.45 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  52.17 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  40.68 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.44 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  39.46 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.61 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.49 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.24 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.54 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.6 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.28 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.44 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.45 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  44.55 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  45.62 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.07 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  42.61 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.43 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  39.7 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.59 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  41.58 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.39 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.35 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.16 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.36 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.54 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.72 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.22 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.71 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  45.91 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.74 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.11 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.39 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  39.08 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  43.69 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  43.69 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  43.69 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  43.69 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.93 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  43.69 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.86 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.08 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.93 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.26 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.26 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.79 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  44.55 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  43.05 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.51 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  44.55 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  45.05 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  37.66 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  41.7 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.75 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.33 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  42.79 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  37.81 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.27 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  42.57 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.57 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.26 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.26 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.27 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.99 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.7 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.93 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  36.72 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.23 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  44.65 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  45.67 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  39.91 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  46.63 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>