171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1962 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.71 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.71 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.82 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.71 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  37.42 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.95 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.25 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.13 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.19 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.95 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  46.36 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.24 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  37.81 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  40 
 
 		 315 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.8 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.85 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.51 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.53 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  40.27 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.89 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  37.89 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.89 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.89 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.38 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0463  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.54 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.49 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.17 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.49 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  36.18 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.89 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.22 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  42.11 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  42.58 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  39.91 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.58 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  39.46 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  41.63 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  42.23 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  36.52 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.1 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  41.83 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  36 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.46 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.22 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  36.79 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.79 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  36.73 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  39.39 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  34.29 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.87 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  40.28 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.38 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  34.2 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  37.89 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.73 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.86 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.37 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.38 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.91 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.1 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.52 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  35.2 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.52 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  37.55 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.76 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.32 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.77 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.64 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.53 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  35.84 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.46 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.3 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.28 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.32 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.5 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.09 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.11 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  34.56 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.22 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.98 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.34 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.86 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.62 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.45 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  30.3 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  42.44 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  36.92 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>