185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1259 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 311 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  73.63 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  72.99 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  65.2 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  65.92 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  61.41 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  62.7 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  49.84 
 
 		 292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  48.38 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.71 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  47.08 
 
 		 288 aa  298  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  47.4 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.4 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.77 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  48.86 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  48.86 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  48.86 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  48.86 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.59 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  48.53 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.32 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.82 
 
 		 300 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  56.57 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.75 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.06 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  56.22 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  47.12 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.25 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  48.06 
 
 		 295 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.77 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.6 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  48.72 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.81 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.97 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.3 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  57.42 
 
 		 284 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.71 
 
 		 302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.96 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  55.38 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  47.08 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  52.63 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.81 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  50.38 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.28 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.28 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.69 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.77 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  46.08 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.57 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  52.12 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.19 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  55.66 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.62 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.62 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.62 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  58.3 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  52.14 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.1 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  57.33 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  44.01 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.55 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  57.85 
 
 		 297 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  50.38 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  49.42 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.62 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.05 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.1 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.24 
 
 		 300 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.48 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.81 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.06 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.67 
 
 		 295 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  55.4 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  51.14 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  57.07 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.49 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.1 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.17 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.71 
 
 		 295 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.54 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.54 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.85 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.15 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.9 
 
 		 284 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  40.76 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.53 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.02 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1992  neutral zinc metallopeptidase  48.74 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.377117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2295  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.74 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000231504  normal  0.331887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.86 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>