176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  100 
 
 
319 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 
293 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.88 
 
 
274 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.93 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.93 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.93 
 
 
317 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.21 
 
 
284 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  52.47 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.73 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  47.64 
 
 
315 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.33 
 
 
303 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  42.31 
 
 
312 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.02 
 
 
295 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.72 
 
 
298 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.26 
 
 
306 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.85 
 
 
319 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.45 
 
 
337 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.5 
 
 
316 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  45.63 
 
 
293 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.27 
 
 
304 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.81 
 
 
290 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.54 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.21 
 
 
310 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.68 
 
 
301 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.61 
 
 
300 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.66 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.66 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.27 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.12 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.06 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  42.54 
 
 
295 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.67 
 
 
284 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.54 
 
 
295 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.39 
 
 
279 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  40.79 
 
 
297 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.28 
 
 
284 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.67 
 
 
294 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.62 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  41.44 
 
 
320 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.91 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.28 
 
 
305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  42.35 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.14 
 
 
285 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.33 
 
 
296 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.75 
 
 
296 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.91 
 
 
292 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.5 
 
 
283 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.18 
 
 
308 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.58 
 
 
310 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 
292 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.33 
 
 
294 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  38.6 
 
 
297 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.25 
 
 
293 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  44.44 
 
 
284 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  38.53 
 
 
297 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.87 
 
 
288 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  42.64 
 
 
316 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  36.86 
 
 
308 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.11 
 
 
311 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.84 
 
 
300 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.24 
 
 
298 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  40.38 
 
 
283 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.05 
 
 
296 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  39.04 
 
 
292 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.71 
 
 
295 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.5 
 
 
291 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.59 
 
 
292 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.04 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.75 
 
 
295 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.42 
 
 
300 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.06 
 
 
282 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  43.09 
 
 
292 aa  155  9e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.5 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  38.91 
 
 
299 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.73 
 
 
292 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.8 
 
 
289 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  42.79 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  39.08 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  39.19 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  34.01 
 
 
295 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.65 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.09 
 
 
284 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  41.12 
 
 
290 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  38.95 
 
 
310 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.65 
 
 
291 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.89 
 
 
302 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.46 
 
 
287 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  44.1 
 
 
282 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.8 
 
 
306 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  42.63 
 
 
283 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.41 
 
 
284 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.46 
 
 
287 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.14 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.28 
 
 
292 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  38.89 
 
 
288 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.28 
 
 
292 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>