176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2313 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.61 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.61 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.61 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.55 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.64 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.61 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.17 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.61 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  44.32 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.9 
 
 		 319 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  53.33 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.35 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.85 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.22 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  49.02 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  43.81 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.77 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.1 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.82 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.4 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.87 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.45 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  41.7 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  42.96 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  41.67 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.56 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.08 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.6 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.02 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.5 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.91 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  37.83 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  37.76 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.85 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  40.91 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  39.85 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.5 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.04 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.64 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.77 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  41.04 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  41.04 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  36.76 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.23 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.69 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.7 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  40 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  36.08 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.13 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.09 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.52 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  40.6 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.34 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  36.8 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.84 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.43 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.21 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  37.17 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.53 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.97 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  37.15 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  37.29 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  38.06 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.84 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  37.59 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.63 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.89 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.73 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  37.36 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.78 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  45.59 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.27 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.74 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  39.26 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  38.02 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.59 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.59 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  37.41 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.41 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.92 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.89 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.02 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.97 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.53 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  36.23 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.74 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.79 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.79 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.98 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.67 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.58 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.17 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.6 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.79 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.99 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.97 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  36.84 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  38.38 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.06 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>