175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1985 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.58 
 
 
317 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.47 
 
 
284 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.83 
 
 
303 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  37.04 
 
 
292 aa  199  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  44.81 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.15 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  40 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.63 
 
 
295 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.6 
 
 
295 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.08 
 
 
282 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.1 
 
 
291 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  42 
 
 
291 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.55 
 
 
289 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.1 
 
 
291 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.71 
 
 
311 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.63 
 
 
298 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.15 
 
 
294 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.71 
 
 
292 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.71 
 
 
292 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.71 
 
 
292 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.75 
 
 
282 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  37.16 
 
 
288 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  43.26 
 
 
293 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.83 
 
 
296 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  37.9 
 
 
292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  39.14 
 
 
329 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.66 
 
 
292 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.81 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.23 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.41 
 
 
296 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.12 
 
 
297 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  36.95 
 
 
289 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.95 
 
 
289 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.08 
 
 
294 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  41.63 
 
 
316 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  37.77 
 
 
308 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  48.06 
 
 
286 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.69 
 
 
288 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.92 
 
 
281 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  43.35 
 
 
287 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  38.58 
 
 
287 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  38.58 
 
 
287 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.72 
 
 
281 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  44.44 
 
 
297 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.92 
 
 
284 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.11 
 
 
284 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  38.58 
 
 
287 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  44.44 
 
 
297 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.63 
 
 
302 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  40.59 
 
 
312 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  39.78 
 
 
299 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.83 
 
 
296 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  38.58 
 
 
287 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.12 
 
 
292 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  40.38 
 
 
296 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  38.58 
 
 
287 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.12 
 
 
292 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  45.41 
 
 
294 aa  185  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 
287 aa  185  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 
287 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.39 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  46.08 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.67 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.81 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.82 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.74 
 
 
293 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.1 
 
 
310 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.25 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  41.26 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  42.51 
 
 
296 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  37.54 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.86 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  39.62 
 
 
295 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.49 
 
 
293 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.4 
 
 
295 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  36.12 
 
 
290 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.35 
 
 
301 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.14 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.83 
 
 
308 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.48 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.31 
 
 
319 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.94 
 
 
288 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  37.33 
 
 
287 aa  178  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.18 
 
 
291 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  41.35 
 
 
297 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.38 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.38 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.96 
 
 
301 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.93 
 
 
306 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  42.06 
 
 
319 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40 
 
 
279 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>