170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05290 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  100 
 
 
287 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  67.99 
 
 
291 aa  381  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  65.26 
 
 
281 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  58.28 
 
 
283 aa  349  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.48 
 
 
281 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  45.63 
 
 
310 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.58 
 
 
288 aa  275  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.83 
 
 
285 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.06 
 
 
284 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.97 
 
 
282 aa  268  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.81 
 
 
284 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.37 
 
 
311 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  45.93 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  50.69 
 
 
284 aa  258  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  46.92 
 
 
292 aa  258  8e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  43.15 
 
 
288 aa  258  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.17 
 
 
279 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  45.89 
 
 
290 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  42.66 
 
 
289 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.66 
 
 
289 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.92 
 
 
294 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.98 
 
 
310 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.1 
 
 
288 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  45.95 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.42 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.16 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  43.49 
 
 
287 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  43.49 
 
 
287 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.53 
 
 
286 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  43.96 
 
 
287 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  43.49 
 
 
287 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43 
 
 
289 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  43.15 
 
 
287 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  45.61 
 
 
296 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.67 
 
 
306 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  248  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  47.64 
 
 
295 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  49.6 
 
 
297 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  46.42 
 
 
295 aa  248  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.07 
 
 
292 aa  248  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  44.74 
 
 
329 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.06 
 
 
280 aa  247  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000282768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.95 
 
 
284 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  43.93 
 
 
292 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  49.19 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  53.05 
 
 
300 aa  245  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.18 
 
 
298 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.88 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.5 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.42 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.08 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  48.44 
 
 
282 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  47.04 
 
 
283 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.74 
 
 
288 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  47.44 
 
 
316 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.96 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.75 
 
 
293 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.93 
 
 
292 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.08 
 
 
293 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.12 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.55 
 
 
293 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.6 
 
 
287 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.6 
 
 
287 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.91 
 
 
300 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  44.11 
 
 
299 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.93 
 
 
292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  42.81 
 
 
287 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.2 
 
 
297 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.93 
 
 
292 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.61 
 
 
292 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.6 
 
 
294 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.65 
 
 
302 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.41 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.92 
 
 
298 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.51 
 
 
279 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  51.85 
 
 
297 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  43.14 
 
 
294 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.1 
 
 
279 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.81 
 
 
301 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.81 
 
 
301 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  51.85 
 
 
320 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.22 
 
 
295 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1992  neutral zinc metallopeptidase  44.22 
 
 
294 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.377117  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  48.03 
 
 
286 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.01 
 
 
284 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2295  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.22 
 
 
294 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000231504  normal  0.331887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.09 
 
 
301 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.75 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.44 
 
 
291 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0463  hypothetical protein  43.75 
 
 
292 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.44 
 
 
292 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.44 
 
 
292 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>