173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0944 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
337 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  65.97 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.05 
 
 
301 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  58.47 
 
 
316 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.59 
 
 
317 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.65 
 
 
284 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.19 
 
 
303 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  45.72 
 
 
312 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  48.85 
 
 
291 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.47 
 
 
274 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.79 
 
 
293 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  47.97 
 
 
315 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.67 
 
 
296 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.67 
 
 
296 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.67 
 
 
317 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  45.45 
 
 
319 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.12 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.57 
 
 
310 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.9 
 
 
319 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  50.44 
 
 
293 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  40.14 
 
 
283 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.96 
 
 
298 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.96 
 
 
290 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.87 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.6 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.6 
 
 
281 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.48 
 
 
284 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  47.14 
 
 
297 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.76 
 
 
294 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  46.58 
 
 
297 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  39.93 
 
 
287 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  43.95 
 
 
295 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  50.25 
 
 
297 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  39.6 
 
 
288 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.98 
 
 
288 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.38 
 
 
283 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.72 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.26 
 
 
295 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  41.2 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  41.2 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  40.82 
 
 
287 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  41.2 
 
 
287 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  41.2 
 
 
287 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.44 
 
 
298 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  38.82 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  45.41 
 
 
329 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.82 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.34 
 
 
284 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.6 
 
 
279 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.58 
 
 
288 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.79 
 
 
292 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.14 
 
 
291 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  49.25 
 
 
320 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.78 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.06 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.02 
 
 
301 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.02 
 
 
301 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.95 
 
 
294 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  44.18 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.19 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.02 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.03 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.41 
 
 
285 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.67 
 
 
291 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.67 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.67 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.67 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  39.7 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  47.14 
 
 
296 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  46.19 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.67 
 
 
284 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.73 
 
 
295 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  45.07 
 
 
294 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.62 
 
 
297 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  45.81 
 
 
284 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.14 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.79 
 
 
296 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.86 
 
 
310 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.75 
 
 
300 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.3 
 
 
284 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.83 
 
 
282 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  41.18 
 
 
287 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  45.71 
 
 
296 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.58 
 
 
296 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.27 
 
 
279 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.99 
 
 
287 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.99 
 
 
287 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.35 
 
 
298 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.95 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.2 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  40.57 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  41.77 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>