182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2562 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
310 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.23 
 
 
303 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.5 
 
 
317 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  51.75 
 
 
291 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.82 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.86 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.86 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.61 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.86 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.13 
 
 
316 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.3 
 
 
298 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  48.53 
 
 
312 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.68 
 
 
293 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.63 
 
 
319 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  53.31 
 
 
293 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.57 
 
 
337 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.4 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.9 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  42.86 
 
 
319 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  45.92 
 
 
315 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.33 
 
 
290 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.35 
 
 
304 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.23 
 
 
284 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.23 
 
 
300 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.88 
 
 
300 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  38.8 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.79 
 
 
293 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.09 
 
 
301 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.09 
 
 
301 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.5 
 
 
298 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.5 
 
 
298 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.06 
 
 
285 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  39.63 
 
 
289 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.63 
 
 
289 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.24 
 
 
288 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.5 
 
 
297 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  36.59 
 
 
329 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.1 
 
 
299 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.5 
 
 
283 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.78 
 
 
300 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.58 
 
 
287 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.58 
 
 
287 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.27 
 
 
292 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  43.87 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  41.22 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.42 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  38.13 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  43.6 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.18 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.1 
 
 
295 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.02 
 
 
292 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.06 
 
 
294 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.83 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  36.81 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.06 
 
 
297 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  44.68 
 
 
296 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.2 
 
 
279 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  42.18 
 
 
293 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.77 
 
 
292 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.18 
 
 
291 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.92 
 
 
293 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.79 
 
 
296 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.31 
 
 
295 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.27 
 
 
292 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  42.79 
 
 
295 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  46.28 
 
 
295 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.28 
 
 
291 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  43.07 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.92 
 
 
292 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  36.49 
 
 
292 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.25 
 
 
300 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.68 
 
 
285 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.57 
 
 
293 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.76 
 
 
291 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40 
 
 
279 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.07 
 
 
296 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
292 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  37.02 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.06 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  37.36 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.86 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.72 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  43.6 
 
 
299 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.12 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  43.62 
 
 
297 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  42.13 
 
 
294 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  36.98 
 
 
287 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  36.98 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>