189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2367 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
294 aa  603  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  93.56 
 
 
295 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  89.83 
 
 
295 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.01 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.98 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  58.42 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.88 
 
 
292 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.74 
 
 
296 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.35 
 
 
298 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.69 
 
 
289 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  50.17 
 
 
288 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  53.92 
 
 
287 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  53.92 
 
 
287 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  53.92 
 
 
287 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  53.58 
 
 
287 aa  294  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  53.92 
 
 
287 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.48 
 
 
296 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  54.73 
 
 
296 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  54.73 
 
 
296 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 
284 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  53.24 
 
 
287 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  50.17 
 
 
289 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.17 
 
 
289 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  48.97 
 
 
290 aa  289  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.14 
 
 
302 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.66 
 
 
285 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  60.36 
 
 
282 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  52.7 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.81 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  49.16 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  50.82 
 
 
308 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  49.67 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  53.24 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.42 
 
 
286 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  55.89 
 
 
297 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  52.86 
 
 
316 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.53 
 
 
294 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50 
 
 
281 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.49 
 
 
295 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  48.97 
 
 
283 aa  279  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  55.56 
 
 
297 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.41 
 
 
311 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  54.33 
 
 
297 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.5 
 
 
295 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.5 
 
 
301 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.5 
 
 
301 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.06 
 
 
296 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.56 
 
 
288 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.56 
 
 
288 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.66 
 
 
298 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.52 
 
 
288 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  50 
 
 
310 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.52 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.52 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  50.68 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  52.92 
 
 
286 aa  271  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.19 
 
 
297 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.7 
 
 
291 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  49.49 
 
 
292 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.67 
 
 
289 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.49 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.65 
 
 
297 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.46 
 
 
284 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  50.51 
 
 
293 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.48 
 
 
285 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.02 
 
 
306 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.66 
 
 
301 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.83 
 
 
292 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.83 
 
 
292 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.36 
 
 
300 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.83 
 
 
292 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.42 
 
 
282 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.81 
 
 
292 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.48 
 
 
291 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.15 
 
 
291 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.81 
 
 
292 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.14 
 
 
292 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.28 
 
 
279 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.56 
 
 
306 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.98 
 
 
293 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.98 
 
 
293 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  46.42 
 
 
287 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  53.88 
 
 
300 aa  255  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  48.97 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.43 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.37 
 
 
305 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  45.39 
 
 
329 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  46.78 
 
 
299 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.92 
 
 
284 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.12 
 
 
292 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  46.84 
 
 
303 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.46 
 
 
279 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.45 
 
 
291 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>