185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1057 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  86.29 
 
 
298 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  88.55 
 
 
295 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  79.73 
 
 
296 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  78.04 
 
 
292 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  72.05 
 
 
295 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  67.91 
 
 
287 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  67.91 
 
 
287 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  60.81 
 
 
290 aa  364  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  63.64 
 
 
294 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  58.45 
 
 
284 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  58.94 
 
 
302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  54.7 
 
 
288 aa  319  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  56.76 
 
 
288 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.73 
 
 
284 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  54.7 
 
 
289 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.7 
 
 
289 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  55.7 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  58.31 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  54.03 
 
 
320 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.11 
 
 
289 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  57 
 
 
291 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  54.95 
 
 
287 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  54.95 
 
 
287 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  54.95 
 
 
287 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  54.95 
 
 
287 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.8 
 
 
281 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  56.23 
 
 
286 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  54.61 
 
 
287 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.48 
 
 
306 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  53.54 
 
 
296 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.82 
 
 
306 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  51.5 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  50.16 
 
 
310 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  52.81 
 
 
316 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.73 
 
 
292 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.73 
 
 
292 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.73 
 
 
292 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.05 
 
 
291 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.84 
 
 
297 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.16 
 
 
294 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  52.32 
 
 
296 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  48.99 
 
 
292 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.72 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.81 
 
 
294 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  51.37 
 
 
283 aa  289  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  54.05 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.32 
 
 
300 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  56.97 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.61 
 
 
310 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.34 
 
 
288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.84 
 
 
296 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  52.4 
 
 
287 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  51.68 
 
 
297 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.7 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.16 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.75 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  51.83 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  51.31 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.67 
 
 
301 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.67 
 
 
301 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  52.36 
 
 
282 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  51.34 
 
 
297 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  49.17 
 
 
295 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.5 
 
 
293 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.77 
 
 
285 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.15 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.37 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  47.97 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.84 
 
 
289 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  49.66 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.83 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.84 
 
 
298 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.69 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.65 
 
 
279 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  56.28 
 
 
279 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.2 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.16 
 
 
286 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.79 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.15 
 
 
285 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1992  neutral zinc metallopeptidase  51.72 
 
 
294 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.377117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2295  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.72 
 
 
294 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000231504  normal  0.331887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  48.15 
 
 
283 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  47.06 
 
 
303 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.64 
 
 
293 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.3 
 
 
293 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  45.36 
 
 
329 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.82 
 
 
284 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  45.82 
 
 
292 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.43 
 
 
308 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.54 
 
 
282 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  55.98 
 
 
300 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>