173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1201 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 319 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  91.8 
 
 		 303 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  86.27 
 
 		 305 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  84.74 
 
 		 308 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  83.44 
 
 		 308 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  83.39 
 
 		 307 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  81.51 
 
 		 281 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.61 
 
 		 300 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.67 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.07 
 
 		 301 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.07 
 
 		 301 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.59 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.02 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.2 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.2 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.41 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.1 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.43 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.57 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.19 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  48.7 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.6 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  46.05 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.71 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  42.77 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.27 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.37 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  47.43 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.72 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.72 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  42.57 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.72 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.91 
 
 		 288 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.74 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.69 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  45.31 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  41.97 
 
 		 292 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  47.51 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.13 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.34 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.41 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.25 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  44.66 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.48 
 
 		 284 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.08 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  45.72 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  43.59 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  44.96 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  45.75 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  45.87 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  42.72 
 
 		 289 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 		 289 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.32 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.46 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.32 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  46.18 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.77 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.48 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.7 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  46.41 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.67 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  43.42 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  43.42 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  43.37 
 
 		 284 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  43.42 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  43.42 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  43.09 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.94 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.98 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  42.07 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.62 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  41.39 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  44.44 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.08 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  43.09 
 
 		 287 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  41.01 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  45.27 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  40.62 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.06 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  43.89 
 
 		 279 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.06 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  38.26 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  44.44 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  42.42 
 
 		 282 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  42.43 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.47 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>