187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4519 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  96.28 
 
 		 316 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  92.93 
 
 		 297 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  88.22 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  77.18 
 
 		 296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  75.84 
 
 		 295 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  76.51 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  70.61 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  69.26 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  68.79 
 
 		 297 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  68.79 
 
 		 297 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  56.76 
 
 		 292 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  55.33 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.18 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.31 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  52.16 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.74 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.01 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.83 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.17 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  59.06 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  55.56 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.32 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.18 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  50.34 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.68 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.52 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.68 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  48.4 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.82 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  50.84 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.84 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  54.08 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  54.26 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  53.16 
 
 		 320 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.01 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.03 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.51 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.4 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.18 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  53.38 
 
 		 282 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  49.84 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.5 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  47.02 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  55.25 
 
 		 289 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.68 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.59 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.96 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.65 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.58 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.65 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.34 
 
 		 289 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  49.32 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  49.32 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  49.32 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  49.32 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  49.32 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  48.7 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  47.95 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.52 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  56.95 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  50.37 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.83 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.5 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.32 
 
 		 284 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  48.99 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.46 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.66 
 
 		 281 aa  254  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.94 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  52.83 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.76 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  46.91 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  44.37 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  47.12 
 
 		 287 aa  248  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  44.37 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  42.9 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1992  neutral zinc metallopeptidase  50.94 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.377117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2295  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.94 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000231504  normal  0.331887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.55 
 
 		 295 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  45.36 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  55.98 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.74 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.93 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  50.92 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>