182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3535 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  593  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  63.14 
 
 
284 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  48.01 
 
 
293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.18 
 
 
303 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.55 
 
 
317 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  57.4 
 
 
296 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  57.4 
 
 
296 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2304  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.73 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.68 
 
 
316 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.57 
 
 
298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.04 
 
 
274 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.51 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  54.91 
 
 
319 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  52.02 
 
 
319 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12595  glycine rich membrane protein  52.46 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.30388  normal  0.484849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.05 
 
 
337 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  47.62 
 
 
315 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.78 
 
 
310 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.78 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.33 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.55 
 
 
295 aa  212  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  43.01 
 
 
283 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  48.71 
 
 
297 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  47.73 
 
 
304 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.67 
 
 
289 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  52.09 
 
 
297 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.59 
 
 
283 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.14 
 
 
300 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  44.15 
 
 
312 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48 
 
 
290 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  48.51 
 
 
279 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  43.01 
 
 
287 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  47.86 
 
 
281 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  52.31 
 
 
287 aa  202  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.06 
 
 
301 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  41.58 
 
 
310 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.06 
 
 
301 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  55.14 
 
 
297 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.6 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  55.38 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  40.82 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  46.19 
 
 
287 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  53.72 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  42.01 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.01 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  42.65 
 
 
308 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  50.53 
 
 
301 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  41.79 
 
 
287 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  41.79 
 
 
287 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  41.79 
 
 
287 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  42.54 
 
 
287 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  41.4 
 
 
299 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.84 
 
 
294 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  53.76 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  42.54 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  54.84 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.91 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  45.29 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  45.49 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  55.32 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  46.19 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  40.07 
 
 
289 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  45.53 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  53.76 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.3 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.18 
 
 
298 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.89 
 
 
285 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.13 
 
 
292 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.58 
 
 
291 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  52.13 
 
 
292 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.98 
 
 
292 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  43.97 
 
 
329 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.13 
 
 
292 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.85 
 
 
284 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  52.43 
 
 
279 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  45.18 
 
 
292 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  54.35 
 
 
294 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.03 
 
 
284 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.73 
 
 
287 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  51.87 
 
 
296 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  49.73 
 
 
287 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.92 
 
 
291 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.58 
 
 
291 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  45.95 
 
 
293 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.23 
 
 
288 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  41.24 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  41.48 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  42.37 
 
 
299 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.61 
 
 
293 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  50.81 
 
 
295 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  51.35 
 
 
288 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  49.46 
 
 
310 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  53.37 
 
 
291 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>