53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3961 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4104  histidine kinase HAMP region domain protein  93.61 
 
 		 389 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3961  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 391 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4071  histidine kinase HAMP region domain protein  93.86 
 
 		 391 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3465  hypothetical protein  44.74 
 
 		 390 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3529  hypothetical protein  44.47 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.716011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3382  hypothetical protein  47.12 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3443  hypothetical protein  43.95 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264114  normal  0.476005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  30.87 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 822 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 622 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0885  hypothetical protein  31.74 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3654  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 822 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 678 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 679 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 587 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 1398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 		 1275 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1397 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  24.85 
 
 		 712 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.84 
 
 		 636 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.51 
 
 		 634 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  28.18 
 
 		 634 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 		 655 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.68 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.84 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.23 
 
 		 761 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.6 
 
 		 633 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.71 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.33 
 
 		 651 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.46 
 
 		 659 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.31 
 
 		 723 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.29 
 
 		 634 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0785  diguanylate cyclase  22.88 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.89 
 
 		 637 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  24.19 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.45 
 
 		 667 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 649 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 		 899 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 805 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.67 
 
 		 646 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2151  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.84 
 
 		 707 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2798  hypothetical protein  24.9 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0430763  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3197  putative methyl accepting chemotaxis protein  23.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 687 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>