45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3529 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3465  hypothetical protein  99.23 
 
 		 390 aa  756    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.716011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3382  hypothetical protein  88.97 
 
 		 390 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3443  hypothetical protein  57.41 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264114  normal  0.476005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4071  histidine kinase HAMP region domain protein  46.97 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3961  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.29 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4104  histidine kinase HAMP region domain protein  45.82 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  33.54 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 822 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 622 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 587 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0885  hypothetical protein  30.98 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3654  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 		 822 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 679 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 678 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 599 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1275 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 		 1398 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 		 1397 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.43 
 
 		 723 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.77 
 
 		 777 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 		 762 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  25.16 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.07 
 
 		 761 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 636 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 		 637 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 		 619 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.08 
 
 		 651 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 667 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  32.41 
 
 		 634 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.11 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 		 649 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 633 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 634 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 1291 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 633 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 633 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 633 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>