54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1634 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1634  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 744 aa  1329    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2226  Pyrrolo-quinoline quinone  95.43 
 
 		 744 aa  975    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  95.3 
 
 		 744 aa  1004    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2177  Pyrrolo-quinoline quinone  60.16 
 
 		 749 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  34.21 
 
 		 392 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  33.73 
 
 		 1454 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 		 383 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 		 432 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 		 463 aa  54.7  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.64 
 
 		 392 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 407 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.65 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 		 652 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 611 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  37.5 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.77 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 		 619 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  31.14 
 
 		 374 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.5 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 423 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 		 687 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 		 422 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 		 431 aa  48.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25 
 
 		 1812 aa  47.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 400 aa  47.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 400 aa  47.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2272 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1682 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  32.4 
 
 		 372 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 486 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 774 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 		 352 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.03 
 
 		 653 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 531 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  30.41 
 
 		 388 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.83 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  27.78 
 
 		 386 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  30.46 
 
 		 402 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.67 
 
 		 616 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.47 
 
 		 386 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.9 
 
 		 457 aa  44.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.91 
 
 		 402 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  23.62 
 
 		 631 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  26.89 
 
 		 381 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.85 
 
 		 385 aa  44.3  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.89 
 
 		 350 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.51 
 
 		 395 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>