100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0046 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0363371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0047  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.045632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  33.86 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  34.82 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  34.02 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  27.91 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  26.19 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  34.17 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  26.19 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  26.19 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  33.05 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.95 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.98 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  33.05 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.78 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  26.19 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  36.25 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.09 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  29.06 
 
 		 345 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  34.26 
 
 		 409 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  31.48 
 
 		 381 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  47.73 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  23.77 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.28 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.33 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 113 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 123 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  28.68 
 
 		 140 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 		 108 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  48.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  29.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  29.9 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  24.6 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  28.33 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  28.45 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.37 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.71 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  29.84 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  27.97 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  25 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  29.37 
 
 		 423 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  23.97 
 
 		 131 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>