More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17541 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 118 aa  233  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  99.15 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  98.31 
 
 		 118 aa  229  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  91.53 
 
 		 118 aa  216  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  76.7 
 
 		 103 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  64.41 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  71.03 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  62.71 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  69.91 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  69.03 
 
 		 118 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  54.87 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  54.87 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 115 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  41.9 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  49.06 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  43.42 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  42 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  46.05 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  39.42 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  42.57 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  39.42 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  37.04 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  41.75 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  41.51 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  38.83 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  36.19 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  37.86 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  39.42 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  41 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  36.27 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  36.27 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  37.14 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>