More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1563 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  100 
 
 		 102 aa  202  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  42.34 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 118 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  41.75 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  39.18 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  46.39 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  41.84 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  41.35 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0159  50S ribosomal protein L24  43.88 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000158735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  44.9 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  36.46 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  37.86 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  41.84 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  41.84 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  40.21 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  41.84 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>