More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16671 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 103 aa  203  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  84.47 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  82.52 
 
 		 118 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  83.5 
 
 		 118 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  82.52 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  78.64 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  78.64 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  76.7 
 
 		 118 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  76.7 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  76.7 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  62.14 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  45.1 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  41.41 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  41.75 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  40.2 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  38.83 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  38.83 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  38.68 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>