More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2221 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  75.44 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  75 
 
 		 115 aa  173  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  73.15 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  73.64 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  73.64 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  75.73 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  68.42 
 
 		 115 aa  160  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  64.15 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  64.15 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  62.26 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  62.14 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  57.94 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  48.51 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47.47 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  43.44 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  41.59 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>