More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0853 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  60.91 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  58.72 
 
 
103 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  58.72 
 
 
103 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  60.55 
 
 
103 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50.46 
 
 
106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.29 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
105 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
105 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  49.54 
 
 
104 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
101 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
106 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  44.35 
 
 
112 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  65.79 
 
 
80 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  63.16 
 
 
80 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
105 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46.09 
 
 
115 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
101 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  49.07 
 
 
104 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
101 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
111 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
108 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
101 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  55.14 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
101 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
110 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
101 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  44.07 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  59.21 
 
 
80 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  46.9 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  48.6 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  52.81 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  63.16 
 
 
80 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  57.89 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  61.84 
 
 
80 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  45.87 
 
 
105 aa  93.6  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  46.36 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  43.64 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  43.8 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  48.15 
 
 
106 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  43.24 
 
 
109 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45.87 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
110 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
103 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  44.44 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  44.34 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
115 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  55.13 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  44.04 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  43.52 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  44.95 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  44.95 
 
 
104 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  55 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  47.17 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  43.64 
 
 
112 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>