2048 genes were found for organism Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CMAQ_0  tRNA  NC_009954  597436  597510  +  75  tRNA-Glu    normal  1  hitchhiker  0.00654824  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0001  CDS  NC_009954  3  8819  -  8817  hypothetical protein  YP_001539845  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0002  CDS  NC_009954  9055  11400  -  2346  protease-like protein  YP_001539846  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0003  CDS  NC_009954  11454  14903  -  3450  hypothetical protein  YP_001539847  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0004  CDS  NC_009954  14977  15444  -  468  ribosomal protein S24E-like protein  YP_001539848  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0005  CDS  NC_009954  15986  17809  -  1824  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  YP_001539849  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0006  CDS  NC_009954  17899  19425  +  1527  sodium/hydrogen exchanger  YP_001539850  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0007  CDS  NC_009954  19499  21175  -  1677  thermosome  YP_001539851  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0008  CDS  NC_009954  21262  22293  -  1032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001539852  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0009  CDS  NC_009954  22269  23402  -  1134  aspartate kinase  YP_001539853  normal  0.743921  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0010  CDS  NC_009954  23708  24331  -  624  50S ribosomal protein L18P  YP_001539854  normal  0.0479899  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0011  CDS  NC_009954  24331  24807  -  477  50S ribosomal protein L19e  YP_001539855  normal  0.0579006  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0012  CDS  NC_009954  24809  25402  -  594  ribosomal protein L32e  YP_001539856  normal  0.118837  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0013  CDS  NC_009954  25529  26380  +  852  hypothetical protein  YP_001539857  normal  0.421224  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0014  CDS  NC_009954  26412  27662  -  1251  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  YP_001539858  normal  0.735237  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0015  CDS  NC_009954  27695  28252  -  558  inorganic diphosphatase  YP_001539859  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0016  CDS  NC_009954  28446  28673  -  228  hypothetical protein  YP_001539860  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0017  CDS  NC_009954  28869  30395  -  1527  hypothetical protein  YP_001539861  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0018  CDS  NC_009954  30562  31980  -  1419  FAD dependent oxidoreductase  YP_001539862  normal  0.417531  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0019  CDS  NC_009954  31977  32987  -  1011  adenylosuccinate synthetase  YP_001539863  normal  0.617132  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0020  CDS  NC_009954  33104  34516  +  1413  adenylosuccinate lyase  YP_001539864  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0021  CDS  NC_009954  34596  35645  +  1050  5-formaminoimidazole-4-carboxamide-1-(beta)-D- ribofuranosyl 5'-monophosphate synthetase-like protein  YP_001539865  normal  0.779693  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0022  CDS  NC_009954  35642  36655  +  1014  5-formaminoimidazole-4-carboxamide-1-(beta)-D- ribofuranosyl 5'-monophosphate synthetase-like protein  YP_001539866  normal  0.653598  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0023  CDS  NC_009954  36930  37445  +  516  hypothetical protein  YP_001539867  normal  0.727004  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0024  CDS  NC_009954  37468  39036  -  1569  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  YP_001539868  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0025  CDS  NC_009954  39036  39458  -  423  like-Sm ribonucleoprotein core  YP_001539869  normal  0.833597  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0026  CDS  NC_009954  39512  39859  +  348  hypothetical protein  YP_001539870  normal  0.457478  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0027  CDS  NC_009954  39876  41549  -  1674  thermosome  YP_001539871  normal  0.196401  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0028  CDS  NC_009954  41674  42141  +  468  NUDIX hydrolase  YP_001539872  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0029  CDS  NC_009954  42314  44539  +  2226  glutamate synthase (NADPH)  YP_001539873  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0030  CDS  NC_009954  44533  46545  +  2013  glutamate synthase alpha subunit  YP_001539874  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0031  CDS  NC_009954  46552  46959  -  408  endoribonuclease L-PSP  YP_001539875  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0032  CDS  NC_009954  47056  47772  +  717  bacterio-opsin activator  YP_001539876  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0033  CDS  NC_009954  47839  50184  +  2346  extracellular solute-binding protein  YP_001539877  normal  0.649183  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0034  CDS  NC_009954  50257  51102  -  846  hypothetical protein  YP_001539878  normal  0.315387  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0035  CDS  NC_009954  51205  51585  +  381  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  YP_001539879  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0036  CDS  NC_009954  51615  52100  -  486  hypothetical protein  YP_001539880  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0037  CDS  NC_009954  52162  53085  -  924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_001539881  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0038  CDS  NC_009954  53135  54499  -  1365  hypothetical protein  YP_001539882  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0039  CDS  NC_009954  54649  54909  -  261  hypothetical protein  YP_001539883  normal  0.997937  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0040  CDS  NC_009954  54915  55967  -  1053  flap endonuclease-1  YP_001539884  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0041  CDS  NC_009954  56167  57486  -  1320  hypothetical protein  YP_001539885  normal  0.395847  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0042  CDS  NC_009954  57724  58605  +  882  proliferating cell nuclear antigen  YP_001539886  normal  0.512471  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0043  CDS  NC_009954  58722  59369  -  648  hypothetical protein  YP_001539887  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0044  CDS  NC_009954  59379  59798  -  420  thioredoxin  YP_001539888  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0045  CDS  NC_009954  59826  60257  -  432  hypothetical protein  YP_001539889  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0046  CDS  NC_009954  60352  61539  -  1188  hypothetical protein  YP_001539890  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0047  CDS  NC_009954  61541  63001  -  1461  hypothetical protein  YP_001539891  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0048  CDS  NC_009954  63085  64509  -  1425  von Willebrand factor type A  YP_001539892  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0049  CDS  NC_009954  64773  66455  +  1683  major facilitator transporter  YP_001539893  normal  0.384329  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0050  CDS  NC_009954  66481  67356  -  876  hypothetical protein  YP_001539894  normal  0.417141  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0051  CDS  NC_009954  67502  68533  -  1032  hypothetical protein  YP_001539895  normal  0.118613  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0052  CDS  NC_009954  68820  69092  +  273  hypothetical protein  YP_001539896  normal  0.493838  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0053  CDS  NC_009954  69097  70113  -  1017  hypothetical protein  YP_001539897  normal  0.448801  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0054  CDS  NC_009954  70381  71232  +  852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001539898  normal  0.419965  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0055  CDS  NC_009954  71442  71681  +  240  hypothetical protein  YP_001539899  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0056  CDS  NC_009954  71857  72648  +  792  nucleotidyl transferase  YP_001539900  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0057  CDS  NC_009954  72641  73630  -  990  hypothetical protein  YP_001539901  normal  0.721176  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0058  CDS  NC_009954  73772  74176  +  405  ferric uptake regulator family protein  YP_001539902  normal  0.0235193  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0059  CDS  NC_009954  74232  74702  +  471  rubrerythrin  YP_001539903  normal  0.0465733  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0060  CDS  NC_009954  74719  75321  +  603  hypothetical protein  YP_001539904  normal  0.0232574  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0061  CDS  NC_009954  75444  76061  -  618  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_001539905  normal  0.0221396  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0062  CDS  NC_009954  76058  76858  -  801  hydroxyethylthiazole kinase  YP_001539906  normal  0.0462865  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0063  CDS  NC_009954  76938  78329  -  1392  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_001539907  normal  0.0906024  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0064  CDS  NC_009954  78338  79384  -  1047  asparagine synthetase A  YP_001539908  normal  0.0556174  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0065  CDS  NC_009954  79548  80807  -  1260  translation-associated GTPase  YP_001539909  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0066  CDS  NC_009954  80903  81235  -  333  hypothetical protein  YP_001539910  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0067  CDS  NC_009954  81315  82127  +  813  band 7 protein  YP_001539911  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0068  CDS  NC_009954  82152  83516  +  1365  hypothetical protein  YP_001539912  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0069  CDS  NC_009954  83749  84060  +  312  hypothetical protein  YP_001539913  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0070  CDS  NC_009954  84060  85028  +  969  hypothetical protein  YP_001539914  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0071  CDS  NC_009954  85034  85513  -  480  hypothetical protein  YP_001539915  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0072  CDS  NC_009954  85554  86162  -  609  hypothetical protein  YP_001539916  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0073  CDS  NC_009954  86231  87637  -  1407  aldehyde dehydrogenase  YP_001539917  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0074  CDS  NC_009954  87718  88905  -  1188  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001539918  normal  1  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0075  CDS  NC_009954  89365  90234  +  870  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  YP_001539919  normal  1  normal  0.72815  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0076  CDS  NC_009954  90266  90931  -  666  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  YP_001539920  normal  1  normal  0.685757  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0077  CDS  NC_009954  91223  91576  +  354  hypothetical protein  YP_001539921  normal  1  normal  0.428668  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0078  CDS  NC_009954  91627  92580  -  954  ROK family protein  YP_001539922  normal  1  normal  0.491062  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0079  CDS  NC_009954  92585  93376  -  792  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  YP_001539923  normal  1  normal  0.460323  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0080  CDS  NC_009954  93529  95676  +  2148  glycoside hydrolase family 42 protein  YP_001539924  normal  1  normal  0.0820956  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0081  CDS  NC_009954  96031  96657  -  627  hypothetical protein  YP_001539925  normal  1  normal  0.10728  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0082  CDS  NC_009954  96791  97513  +  723  hypothetical protein  YP_001539926  normal  1  normal  0.14198  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0083  CDS  NC_009954  97792  99759  +  1968  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  YP_001539927  normal  0.536917  normal  0.152284  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0084  CDS  NC_009954  99770  101539  -  1770  major facilitator transporter  YP_001539928  normal  0.0483176  normal  0.0703431  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0085  CDS  NC_009954  101562  102728  -  1167  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001539929  normal  0.011267  normal  0.223088  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0086  CDS  NC_009954  102776  104464  -  1689  hypothetical protein  YP_001539930  normal  0.876374  normal  0.238085  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0087  CDS  NC_009954  104497  105297  -  801  hypothetical protein  YP_001539931  normal  1  normal  0.248658  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0088  CDS  NC_009954  105294  105533  -  240  hypothetical protein  YP_001539932  normal  0.847769  normal  0.362262  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0089  CDS  NC_009954  105597  107306  -  1710  radical SAM domain-containing protein  YP_001539933  normal  0.63352  normal  0.503154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0090  CDS  NC_009954  107368  109182  -  1815  glycoside hydrolase 15-related  YP_001539934  normal  0.33989  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0091  CDS  NC_009954  109421  109777  +  357  hypothetical protein  YP_001539935  normal  0.312735  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0092  CDS  NC_009954  109829  110770  -  942  ornithine carbamoyltransferase  YP_001539936  normal  0.371923  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0093  CDS  NC_009954  110816  111886  -  1071  radical SAM domain-containing protein  YP_001539937  normal  0.488444  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0094  CDS  NC_009954  111980  112336  -  357  hypothetical protein  YP_001539938  normal  0.345095  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0095  CDS  NC_009954  112385  115165  +  2781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001539939  normal  0.477622  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0096  CDS  NC_009954  115333  115629  +  297  hypothetical protein  YP_001539940  normal  0.515337  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0097  CDS  NC_009954  115659  116024  -  366  30S ribosomal protein S10P  YP_001539941  normal  0.718504  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0098  CDS  NC_009954  116268  117056  +  789  methyltransferase type 11  YP_001539942  normal  0.972554  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0099  CDS  NC_009954  117421  117894  -  474  hypothetical protein  YP_001539943  normal  0.664087  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>