More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0020 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0020  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 470 aa  959    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1673  adenylosuccinate lyase  42.02 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  41.39 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  41.83 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  40.94 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0889  adenylosuccinate lyase  39.64 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1126  adenylosuccinate lyase  39.64 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  38.86 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  38.5 
 
 		 456 aa  286  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0786  adenylosuccinate lyase  38.94 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3914  adenylosuccinate lyase  37.72 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0304916  hitchhiker  0.00468958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0652  adenylosuccinate lyase  40.66 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3158  adenylosuccinate lyase  39.78 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.764466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  37.5 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  37.39 
 
 		 482 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  38.14 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  38.8 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35970  Adenylosuccinate lyase  38.43 
 
 		 488 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4662  adenylosuccinate lyase  36.62 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163843  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  36.44 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  36.98 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 		 462 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  37.61 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  38.67 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2736  adenylosuccinate lyase  38.43 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  36.61 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  35.96 
 
 		 451 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  35.43 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  37.39 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1158  adenylosuccinate lyase  36.64 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  37.39 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  37.61 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  38.36 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  36 
 
 		 455 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  36.18 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  35.32 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  35.32 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  37.69 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  35.76 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  35.32 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  35.32 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 		 462 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  36.57 
 
 		 455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  38.22 
 
 		 455 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  36.75 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  35.98 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  37.61 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  34.98 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  35.15 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25530  adenylosuccinate lyase  39.11 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.73948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  34.92 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  38.27 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  36.43 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  35.6 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  35.52 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0924  adenylosuccinate lyase  38.03 
 
 		 486 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000172429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1245  adenylosuccinate lyase  36.12 
 
 		 463 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00902866  normal  0.920871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3228  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4033  adenylosuccinate lyase  36.91 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4049  adenylosuccinate lyase  36.42 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  35.56 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  35.94 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3826  adenylosuccinate lyase  36.24 
 
 		 480 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  35.52 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  35.76 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  38.05 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>