33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0072 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  413  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  31.34 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  25.12 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  25.46 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  24.54 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  22.09 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  24.54 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  24.54 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  22.35 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  24.54 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  26.28 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  26.28 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  26.28 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  26.47 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  24.2 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  24.39 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  25.25 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  27.08 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  23.42 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  24.88 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  34.09 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  22.01 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  24.29 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  24.54 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  28.71 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  35.14 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  23.6 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  35.14 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  25 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  30.59 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>