1244 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg2_4371  CDS  NC_011368  125  811  687  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002278369  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4372  CDS  NC_011368  814  2103  1290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_002278370  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4373  CDS  NC_011368  2219  3670  1452  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_002278371  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4374  CDS  NC_011368  3681  4517  837  HpcH/HpaI aldolase  YP_002278372  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4375  CDS  NC_011368  4514  4966  453  MaoC domain protein dehydratase  YP_002278373  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4376  CDS  NC_011368  4966  6831  1866  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  YP_002278374  normal  0.672577  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4377  CDS  NC_011368  6839  8449  1611  Propionyl-CoA carboxylase  YP_002278375  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4378  CDS  NC_011368  8446  9591  1146  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002278376  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4379  CDS  NC_011368  9747  10007  261  prevent-host-death family protein  YP_002278377  normal  0.355289  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4380  CDS  NC_011368  9997  10416  420  hypothetical protein  YP_002278378  normal  0.827611  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4381  CDS  NC_011368  10400  11425  1026  transcriptional regulator, AraC family  YP_002278379  normal  0.165128  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4382  CDS  NC_011368  11563  12330  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002278380  normal  0.0363369  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4383  CDS  NC_011368  12351  13538  1188  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_002278381  normal  0.325311  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4384  CDS  NC_011368  13553  14680  1128  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002278382  normal  0.17615  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4385  CDS  NC_011368  14744  15976  1233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (2-methylpropanoyl-transferring)  YP_002278383  normal  0.157612  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4386  CDS  NC_011368  15993  16991  999  Transketolase central region  YP_002278384  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4387  CDS  NC_011368  16995  18224  1230  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  YP_002278385  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4388  CDS  NC_011368  18228  19625  1398  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_002278386  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4389  CDS  NC_011368  19711  20472  762  band 7 protein  YP_002278387  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4390  CDS  NC_011368  20501  21904  1404  protein of unknown function DUF107  YP_002278388  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4391  CDS  NC_011368  22307  22825  519  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_002278389  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4392  CDS  NC_011368  23044  23604  561  hypothetical protein  YP_002278390  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4393  CDS  NC_011368  23667  24971  1305  hypothetical protein  YP_002278391  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4394  CDS  NC_011368  24987  25931  945  type II secretion system protein  YP_002278392  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4395  CDS  NC_011368  25939  26892  954  type II secretion system protein  YP_002278393  normal  0.925008  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4396  CDS  NC_011368  26889  28334  1446  type II secretion system protein E  YP_002278394  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4397  CDS  NC_011368  28351  28923  573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002278395  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4398  CDS  NC_011368  28920  30062  1143  response regulator receiver protein  YP_002278396  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4399  CDS  NC_011368  30092  30718  627  TadE family protein  YP_002278397  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4400  CDS  NC_011368  30712  31191  480  TadE family protein  YP_002278398  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4401  CDS  NC_011368  31188  32792  1605  hypothetical protein  YP_002278399  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4402  CDS  NC_011368  32884  33177  294  hypothetical protein  YP_002278400  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4403  CDS  NC_011368  33161  34648  1488  type II and III secretion system protein  YP_002278401  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4404  CDS  NC_011368  34707  35624  918  Flp pilus assembly protein CpaB  YP_002278402  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4405  CDS  NC_011368  35723  35920  198  hypothetical protein  YP_002278403  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4406  CDS  NC_011368  36181  36717  537  peptidase A24A prepilin type IV  YP_002278404  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4407    NC_011368  36725  36940  216      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4408  CDS  NC_011368  37105  37476  372  hypothetical protein  YP_002278405  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4409  CDS  NC_011368  37904  39331  1428  Integrase catalytic region  YP_002278406  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4410  CDS  NC_011368  39671  40582  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_002278407  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4411  CDS  NC_011368  40722  41795  1074  tartrate dehydrogenase  YP_002278408  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4412  CDS  NC_011368  41992  42468  477  transcriptional regulator, AsnC family  YP_002278409  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4413  CDS  NC_011368  42598  43974  1377  hypothetical protein  YP_002278410  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4414  CDS  NC_011368  43988  44821  834  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002278411  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4415  CDS  NC_011368  45233  45901  669  haloacid dehalogenase, type II  YP_002278412  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4416  CDS  NC_011368  46212  47669  1458  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_002278413  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4417  CDS  NC_011368  47961  48932  972  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  YP_002278414  normal  0.936913  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4418  CDS  NC_011368  49071  50066  996  Ornithine cyclodeaminase  YP_002278415  normal  0.405243  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4419    NC_011368  50387  50497  111      normal  0.343602  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4420  CDS  NC_011368  50624  52078  1455  Aldehyde Dehydrogenase  YP_002278416  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4421  CDS  NC_011368  52180  53457  1278  FAD dependent oxidoreductase  YP_002278417  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4422  CDS  NC_011368  53776  54486  711  protein of unknown function DUF861 cupin_3  YP_002278418  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4423  CDS  NC_011368  54587  54943  357  protein of unknown function DUF861 cupin_3  YP_002278419  normal  0.728084  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4424  CDS  NC_011368  54958  55881  924  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_002278420  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4425  CDS  NC_011368  55898  57025  1128  acetylornithine deacetylase  YP_002278421  normal  0.779793  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4426  CDS  NC_011368  57266  58141  876  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002278422  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4427  CDS  NC_011368  58385  59278  894  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002278423  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4428  CDS  NC_011368  59304  60179  876  transcriptional regulator, AraC family  YP_002278424  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4429  CDS  NC_011368  60272  61834  1563  4-hydroxyphenylacetate 3-hydroxylase  YP_002278425  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4430  CDS  NC_011368  61845  62357  513  flavin reductase domain protein FMN-binding  YP_002278426  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4431  CDS  NC_011368  62407  63588  1182  cytochrome P450 monooxygenase  YP_002278427  normal  0.54502  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4432  CDS  NC_011368  63622  65100  1479  Aldehyde Dehydrogenase  YP_002278428  normal  0.0316709  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4433  CDS  NC_011368  65162  66616  1455  amino acid permease-associated region  YP_002278429  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4434  CDS  NC_011368  66937  67722  786  transcriptional regulator, IclR family  YP_002278430  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4435  CDS  NC_011368  67722  68975  1254  hypothetical protein  YP_002278431  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4436  CDS  NC_011368  68972  69622  651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  YP_002278432  hitchhiker  0.00258568  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4437  CDS  NC_011368  69640  70995  1356  hypothetical protein  YP_002278433  normal  0.0691941  normal  0.936595  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4438  CDS  NC_011368  70998  72281  1284  aminotransferase class-III  YP_002278434  normal  0.0985724  normal  0.717239  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4439  CDS  NC_011368  72289  73308  1020  aminoglycoside phosphotransferase  YP_002278435  normal  0.637315  normal  0.494551  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4440  CDS  NC_011368  73361  73747  387  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase  YP_002278436  normal  normal  0.436322  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4441  CDS  NC_011368  73791  75308  1518  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  YP_002278437  normal  normal  0.411822  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4442  CDS  NC_011368  75335  76315  981  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  YP_002278438  normal  normal  0.266673  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4443  CDS  NC_011368  76375  77826  1452  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_002278439  normal  normal  0.094172  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4444  CDS  NC_011368  77852  78724  873  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  YP_002278440  normal  normal  0.128899  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4445  CDS  NC_011368  78724  79527  804  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  YP_002278441  normal  0.549639  normal  0.132657  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4446  CDS  NC_011368  79540  80346  807  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  YP_002278442  normal  normal  0.0830561  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4447  CDS  NC_011368  80452  81240  789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002278443  normal  normal  0.052373  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4448  CDS  NC_011368  81256  82035  780  hypothetical protein  YP_002278444  normal  0.756566  normal  0.0308973  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4449  CDS  NC_011368  82047  82436  390  hypothetical protein  YP_002278445  normal  0.904253  normal  0.0764315  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4450  CDS  NC_011368  82470  83414  945  transcriptional regulator, AraC family  YP_002278446  normal  0.29327  normal  0.0834018  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4451  CDS  NC_011368  83430  84146  717  ABC transporter related  YP_002278447  normal  0.0769316  normal  0.0804857  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4452  CDS  NC_011368  84148  84852  705  ABC transporter related  YP_002278448  normal  0.133322  normal  0.130347  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4453  CDS  NC_011368  84849  85886  1038  inner-membrane translocator  YP_002278449  normal  0.57987  hitchhiker  0.00971028  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4454  CDS  NC_011368  85883  86749  867  inner-membrane translocator  YP_002278450  normal  0.242993  normal  0.0168386  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4455  CDS  NC_011368  86818  88071  1254  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  YP_002278451  normal  0.0616202  normal  0.0186598  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4456  CDS  NC_011368  88131  89726  1596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_002278452  normal  0.691807  normal  0.0210476  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4457  CDS  NC_011368  89730  91136  1407  Aldehyde Dehydrogenase  YP_002278453  normal  0.399001  normal  0.0106481  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4458  CDS  NC_011368  91239  92225  987  transcriptional regulator, AraC family  YP_002278454  normal  decreased coverage  0.00884299  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4459  CDS  NC_011368  92336  92839  504  transcriptional regulator, MarR family  YP_002278455  normal  decreased coverage  0.00777339  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4460  CDS  NC_011368  93098  93364  267  hypothetical protein  YP_002278456  normal  0.894817  decreased coverage  0.0074977  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4461  CDS  NC_011368  93491  94141  651  Rieske (2Fe-2S) domain protein  YP_002278457  normal  0.408386  normal  0.0170957  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4462  CDS  NC_011368  94138  94983  846  hypothetical protein  YP_002278458  normal  normal  0.0193122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4463  CDS  NC_011368  94980  95642  663  Glutathione S-transferase domain  YP_002278459  normal  normal  0.0595447  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4464  CDS  NC_011368  95644  97023  1380  amidohydrolase  YP_002278460  normal  normal  0.0716528  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4465  CDS  NC_011368  97049  98146  1098  basic membrane lipoprotein  YP_002278461  normal  normal  0.117985  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4466  CDS  NC_011368  98150  99670  1521  ABC transporter related  YP_002278462  normal  normal  0.130142  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4467  CDS  NC_011368  99670  100770  1101  inner-membrane translocator  YP_002278463  normal  normal  0.187489  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4468  CDS  NC_011368  100767  101678  912  inner-membrane translocator  YP_002278464  normal  normal  0.0443774  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4469  CDS  NC_011368  101877  103064  1188  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  YP_002278465  normal  normal  0.0508385  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_4470  CDS  NC_011368  103576  104889  1314  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  YP_002278466  normal  normal  0.214365  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>